构建光开关配体库的开发平台

光开关小分子已成为分析生物系统的重要工具。光可调谐分子的发现使人们能够通过精确的时空控制来研究细胞内复杂的生理反应,从而调节其功能。虽然工具很强大,从头设计往往是具有挑战性的,因为它需要有关配体和受体结构的详细信息。

在最近的一次OBC出版,集团阿尔伯塔大学的拉特米尔·德达教授讨论了开发光响应(LR)配体库的策略,可以通过嫁接已知的LR结构,如偶氮苯,在具有既定生物活性的分子上。这样,识别新的LR配体的挑战可以通过从已知具有理想生物学功能的标记LR化合物库中进行选择来解决。

他们的研究概述了一个概念证明的图书馆使用合成的lr双环肽,其中含有羟胺和含偶氮苯的二氯苯(HADCAZ)连接剂。

HADCAz作为一个三点的关键,可以通过其正交反应的“硫反应”和“醛反应”连接点用于多肽的双环化。作者成功地证明了一个小库的双环肽的合成,从线性,一锅无保护肽(长度约20个氨基酸),双分子亲核加成和肟形成两个环的两步反应。经365 nm光照射后,肽结合的HADCAz连接分子可逆地转换成顺式构象,并用分子动力学(MD)模拟评估构象变化,其性质似乎取决于肽的长度。

虽然对于广泛的应用程序仍然需要优化,这项工作提供了一个多功能的平台,从中可以探索光化学遗传学和光药理学领域的许多途径。

要了解更多信息,请参阅:

光响应双环肽
默罕默德·R。贾法里
多伊:10.1039/C7OB03178E


维多利亚Corless目前正在攻读博士学位。在有机化学教授。新利手机客户端多伦多大学的安德烈·尤丁说。她的研究集中在动力学两性构建块的合成上,为化学选择性转化的发展提供了一个多功能的平台,特别强调创造新的生物活性分子。

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水蚤生物碱[7-5-5]三环核的新途径

到目前为止,从常绿植物中分离出320多种新生物碱。Daphniphyllum属。在古代,树皮和树叶的提取物Daphniphyllum植物被用于中草药治疗小病和疼痛。最近的研究发现Daphniphyllum生物碱类具有显著的不同生物活性。包括抗癌,抗氧化和血管舒张活性。然而,它们独特的多环结构包含多个四元立体中心,使这些生物碱综合起来具有挑战性。

一个最近的OBC出版物通过名古屋大学的福山和横滨一种常见的结构核的合成报告Daphniphyllum生物碱类。常见的[7-5-5]三环核心具有一个四元碳中心,两个相邻的立体中心和一个四取代C-C双键。

研究从合成相邻的立体中心开始,这最终是通过claisen-ireland重排实现的,分离出73%的产量(1步),dr=6.3:1。

接下来将讨论具有挑战性的四取代C-C双键。报告了[7-5-5]三环芯四取代C-C烯烃安装的有限程序。这种取代双键的高度拥挤的性质导致了不稳定的蚀作用,它们反映在导致它们的过渡状态中。因此,[7-5-5]三环核的四取代C-C双键是通过消除中间产物e1cb来实现的28生成a,b-不饱和酮29有78%的独立收益率。
广泛的调查显示,季碳中心可以通过2,3- wittig重排,立体选择性地发生在阻碍较少的双环中间体表面。相当有效,这种转变产生了中间产物36它包含一个乙烯基,用于构建7元环。最后的步骤包括闭合环复分解和分子内羰基烯反应以完成[7-5-5]环系统。

这项创造性的研究为Daphniphyllum具有[7-5-5]三环核的生物碱。

要了解更多信息,请参阅:

[7-5-5]三环核的合成Daphniphyllum生物碱
北海由介,福山和横岛聪
多伊:10.1039 / C8OB00859K


维多利亚Corless目前正在攻读博士学位。在有机化学教授。新利手机客户端多伦多大学的安德烈·尤丁说。她的研究集中在动力学两性构建块的合成上,为化学选择性转化的发展提供了一个多功能的平台,特别强调创造新的生物活性分子。

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第十六届主客及超分子化学研讨会海报奖得主新利手机客户端

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第16届主宾和超分子化学研讨会是一个年度研讨会,涵盖了与分子识别和超分子化学有关的化学科学的各个方面。新利手机客户端新利手机客户端

今年的研讨会于2018年6月2日至3日在东京理工大学举行,新利手机客户端日本。该活动包括佐佐木重树博士的专题讲座,并邀请林隆博士和Ariga Katsuhiko博士进行讲座。

我们很高兴地宣布有机和生物分子化学新利手机客户端海报奖颁给:展一洋(东京大学)-客体包封对疏水装置动力学稳定性的影响

祝贺詹和所有在研讨会上获得海报奖的人!

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新型合成抗体模拟物用于改良治疗

能够模拟蛋白质结合和/或功能位点的分子是开发潜在候选药物的一条有希望的途径。该策略允许将关键结构特征融入到更简单的支架中,并为开发具有增强和模块化生物活性的分子提供了广泛的机会。

最近的OBC出版通过教授罗伯Liskamp格拉斯哥大学在发展和应用互补性决定区(CDR)模拟方面应对了当前的挑战,最近已被证明能成功地模仿合成抗体。

将大蛋白简化为简单结构的概念需要合成预先组织的分子支架,作为连接生物活性CDR组件的核心结构单元。这种类似物已被证明具有更高的生物利用度,蛋白水解稳定性和免疫原性反应降低。

该小组此前报道过ctv衍生支架的合成(图,化合物2),不同的肽段可以结合在上面,基本上生成具有新颖和可调的物理化学性质的合成cdr。然而,贫穷solubulity限制了该类化合物在药物发现过程中的进展。

当前的研究专注于开发可扩展的,一锅法合成水溶性ctv衍生支架(图,化合物3,4)含有单元体或二甘醇间隔体。通过铜(I)催化叠氮化物-炔烃环加成反应,可实现CTV衍生支架的后期多样化。这就产生了一系列不同的合成抗体,结果表明,这与用于治疗肿瘤坏死因子α(htnfa)介导的自身免疫疾病的单克隆抗体(mab)英夫利昔单抗(remicade)的抗原结合位点相似。D在11到66毫米之间测量。同时还需要进一步的改进以提高评价的溶解度体外,这项研究证明了这项工作的潜力,超越抗体模拟。由于任何azide句柄都可以链接到ctv衍生的支架上,我们可以预见这种方法在替代蛋白质模拟中的应用。

要了解更多信息,请参阅:

环三维拉特林(CTV)衍生物分子支架合成英夫利昔单抗抗体蛋白
Ondřej Longin,
doi:10.1039/c8ob01104d


维多利亚Corless目前正在攻读博士学位。在有机化学教授。新利手机客户端多伦多大学的安德烈·尤丁说。她的研究集中在动力学两性构建块的合成上,为化学选择性转化的发展提供了一个多功能的平台,特别强调创造新的生物活性分子。

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生物正交反应性的控制策略

生物正交反应提供了一种独特的、高效的研究天然环境中生物分子的方法。经典的例子包括天然化学结扎,施陶丁格结扎,尽管在过去的几十年里新利手机客户端,文献中已经报道了很多例子,但是点击化学。

大多数以开发生物正交试剂为中心的研究都集中在提高动力学和选择性上。在活的有机体内。然而,较少研究的是通过光或特定酶的控制激活来调节其在生物环境中的反应性的试剂。

在他们最近OBC出版斯科特·劳克林教授并介绍了新型环丙烷四嗪结扎的模块化控制。以前的报告已经证明,在这些类型的反应中,由于在过渡状态下,C3取代基和四嗪之间的不利立体相互作用,C3二取代环丙烯的反应性较差(图a)。为此,3n-取代螺环丙烯的设计是通过一种“反应性笼化策略”来控制结扎,其中引入了一个可移动的体积n-保护组严格抑制与四嗪搭档的过早反应(图B和C)。

以市售的起始材料为原料,合成了具有良好总收率的新型环丙烯骨架,并成功地应用于四嗪改性蛋白质的标记。鉴于轻可移动氮保护基团的广泛使用,该小组预测,他们的可激活环丙烯支架将能够在多种波长下进行控制。虽然还需要对反应动力学进行优化,这项研究为不同的笼型群在调节特定生物系统和应用的反应性方面的应用提供了有趣的机会。

要了解更多信息,请参阅:

控制生物正交反应性的笼状环丙烯
Pratik Kumar
doi:10.1039/c8ob01076e


维多利亚Corless目前正在攻读博士学位。在有机化学教授。新利手机客户端多伦多大学的安德烈·尤丁说。她的研究集中在动力学两性构建块的合成上,为化学选择性转化的发展提供了一个多功能的平台,特别强调创造新的生物活性分子。

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2017年有机与生物分子化学优秀审稿人新利手机客户端

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优秀评审员有机和生物分子化学新利手机客户端2017

我们想强调的是有机和生物分子化学新利手机客户端在2017年,由编辑团队挑选,因为他们对杂志的重大贡献。评审员是根据人数选出的,在过去12个月中完成的报告的及时性和质量。

我们要对这里列出的那些人以及所有支持这本杂志的评论人表示衷心的感谢。每一位杰出的审稿人都将获得一份证书,以表彰他们的重大贡献。

博航科技大学教授,新利手机客户端韩国,ORCID: 0000-0001-7192-7215
戴玉敏博士,弗吉尼亚理工大学,美国
德国海德堡大学Stephen Hashmi博士,德国ORCID: 0000-0002-6720-8602
刘世元博士,波士顿学院,默克特化学中心,新利手机客户端美国兽药编号:0000-0003-3148-9147
萨拉曼卡大学Luis Sim_n博士,西班牙,兽药编号:0000-0002-3781-0803
斯特拉斯克莱德大学科林马林教授,英国
加拿大多伦多大学马克泰勒博士,兽药编号:0000-0003-3424-4380
马里奥·瓦瑟博士,约翰内斯·开普勒大学林茨分校,奥地利,兽药编号:0000-0002-8421-8642
上海有机化学研究所尤树理教授,新利手机客户端中国兽药编号:0000-0003-4586-8359
周健博士,华东师范大学,中国

我们还要感谢有机和生物分子化学新利手机客户端董事会和更广泛的社区继续支持该杂志,作为作者,审稿人和读者。

如果你想成为我们期刊的审稿人,你可以在我们的作者和审稿人资源中心。

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第24届IUPAC物理有机化学国际会议新利手机客户端

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有机和生物分子化学新利手机客户端是我们的赞助商吗第24届国际物理有机化学会议(ICPOC 24)新利手机客户端会议将于2018年7月1日至6日在阿尔加夫大学举行,Faro葡萄牙。

ICPOC会议汇集了来自学术界和工业界的化学家,活跃于有机化学领域,新利手机客户端物理化学,新利手机客户端理论化学,新利手机客户端催化和超分子化学。新利手机客户端

物理有机化学的广度在ICPOC 24中由一系列与会议3个议题相关新利手机客户端的专题介绍所代表:

  • 有机反应的物理基础
  • 机理与催化
  • 超分子和系统化学新利手机客户端

完整的发言者名单可以在网上找到。

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手性2018

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我们很荣幸地宣布有机和生物分子化学新利手机客户端将赞助手性2018。会议将于2018年6月10日至13日在普林斯顿大学举行,新泽西美国。

手性2018将把立体化学的传统核心领域与具有科学重要性的新兴领域结合起来。新利手机客户端

演讲者包括我们的一些助理编辑和董事会成员:

  • 金泉玉(斯克里普斯)
  • Motomu Kanai(东京)
  • Dean Tantillo(加州大学戴维斯分校)
  • 本·弗林加(u格罗宁根)
  • 海尔玛·温纳梅尔斯(苏黎世ETH)
  • 舒利友(上海有机化学研究所)新利手机客户端

注册关闭2018年4月30日

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新型双脲阴离子载体促进了活细胞环境中离子的转运

能够促进离子跨细胞膜转运的合成分子的发展已成为一个突出和活跃的研究领域。这些化合物模仿天然离子团的活性,在材料科学中得到了广泛的应用,新利手机客户端化学生物学和医学。

大多数已知的合成离子载体有助于阳离子的运输。然而,有越来越多的证据支持阴离子选择性离子载体(阴离子载体)作为抗癌剂和新的线索在治疗渠道病方面的能力,比如囊性纤维化,由功能失调的离子通道或相关调节蛋白引起。最终的希望是,他们可以用来恢复离子通道的功能,在这种情况下。

实现实际应用的一个重要步骤是,不仅在合成水泡分析中,而且在活细胞环境中,证明阴离子载体的活性。在合作研究中之间的教授。菲利普·盖尔悉尼大学的,教授。戴维斯教授。大卫·谢泼德布里斯托尔大学,一系列的生物活性昊图公司-采用费歇尔大鼠甲状腺细胞的生物阴离子转移法,对苯撑双脲(opbu)阴离子载体进行了研究。这类阴离子荧光素很容易从市售的起始材料中制备出来,使用简单的化学方法可以方便地进行结构变化和结构-活性关系的研究。新利手机客户端

结果表明,双尿素阴离子团的活性与电子性质和亲脂性有关。有趣的是,虽然亲脂性被证明可以促进内在活性,但它对可传递性也有相反的影响,这阻碍了阴离子载体在活细胞中的作用。双脲4A(图)被证明是所有分析中最有效的,基于二氟中心支架。

这项研究对这类阴离子团的生物活性提供了有趣的见解,并为其在医学上的潜在应用迈出了有希望的第一步。

要了解更多信息,请参阅:

离子运输昊图公司-苯双脲跨细胞膜和囊泡膜
克里斯托弗M迪亚斯,李鸿宇,瓦基尼尔,路易丝。Karagiannidis
多伊:
10.1039 / C7OB02787G


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新的刚性自旋标记用于增强RNA的EPR研究

电子顺磁共振(EPR)是研究含有不成对电子的化学物质的有力技术。它在许多领域有着深远的应用,因为它可以用来解释结构,给定系统中的电子和构象动态特性。

在生物环境中,顺磁探针已经被开发成“自旋标记”所需的生物分子,使用一种称为位置定向自旋标记(SDSL)的技术。结合其他方法,EPR已经成为研究接近自身生理状态的蛋白质的一种有效手段,可以用来收集有关自旋标记侧链的直接环境的信息,以及测量蛋白质内分子内和分子间的距离。一个挑战是开发刚性自旋标记,以改进如果自旋标签之间的距离因构象的灵活性而保持不变,则距离测量的准确性是最可靠的信息。

在他们最近的OBC出版教授。斯诺里·西格德森冰岛大学教授。托马斯Prisner歌德大学描述了一种增强型尿苷异吲哚啉氧化亚氮衍生物的开发。(伊姆河),RNA构象受限自旋标签的第一个例子。

有限的流动性伊姆河是由于氮氧基的N-O键与连接它到尿苷基的键位于同一个轴上。作为一个结果,键的旋转不会彻底改变氧化亚氮的位置。此外,伊姆河结果表明,在双链RNA中与碱基位点具有高度的特异性和亲和力。在这里,氮氧化物探针与孤立的尿嘧啶基之间的分子内氢键进一步增强了刚性。伊姆河是RNA的EPR研究的一个很有前景的标签,提供高度有用的动态结构信息,不受构象灵活性的影响。

要了解更多信息,请参阅:

RNA的半刚性异吲哚衍生的自旋标记
Dnyaneshwar B。Gophane,
DOI: 10.1039 / C7OB02870A


维多利亚Corless目前正在攻读博士学位。在有机化学教授。新利手机客户端多伦多大学的安德烈·尤丁说。她的研究集中在动力学两性构建块的合成上,为化学选择性转化的发展提供了一个多功能的平台,特别强调创造新的生物活性分子。

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