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通过更便宜的“生命之书”

绘制人类基因组计划是世界上最大的科学合作之一。完成“的全基因组测序生命之书“在1000名科学家的努力和30亿美元的预算下,花了10多年时间。这个庞大的项目完成20年后,由于更先进的测序工具,现在可以在8天内以1000美元左右的价格完成一个完整的人类基因组测序。由于基因组测序领域已被更多的应用所接受,因此今天仍有必要进一步改进基因组测序工具,包括法医学,疾病建模与识别,以及个性化药物(例如,识别导致药物在一个病人身上起作用而在另一个病人身上起作用的基因)。

最初的测序技术依赖于标准的DNA电泳技术,如平板凝胶和毛细管,一次只能制备少量样品。这个样品制备限制是人类基因组计划期间成本和加工时间增加的主要原因。在过去的几十年中,许多工作都致力于改进样品制备技术。作为第一步,电泳技术已经优化到提高样本吞吐量用户友好,更小的,以及功能平台。传统的DNA分离凝胶,几十年来一直是金本位,已经被微制作的柱状阵列和纳米尺度的确定性横向位移阵列所取代。

IBM T.J.的研究人员最近展示了纳米级确定性横向位移阵列的一个很好的例子。纽约西奈山沃森研究中心和伊坎医学院,美国。在这项工作中,研究人员将DNA分为100-10000个碱基对,大小选择分辨率为200个碱基对。为了实现这一目标,在硅片上制作了四种不同的微芯片结构,其中阵列和纳米柱的尺寸针对每种配置进行了调整,以获得所选范围的DNA片段的最佳分离性能。每种配置都包含几个单独的阵列,以便在一个芯片中进行独立运行。不是施加电场,研究人员用压力驱动力把碎片分开。该策略尤其适用于在不受缓冲条件影响的情况下分离非带电物种(例如,离子强度)。

分离机理在纳米尺度上,确定的侧向位移阵列很简单:如果DNA片段的大小大于支柱的直径,碎片以大角度偏向收集墙,也称为颠簸模式.如果DNA片段的大小小于柱子的直径,碎片以名义上为零的角度移动,称为曲折模式.在这样一个系统中,DNA片段的扩散导致了中间的迁移角,称为部分通气模式.由于不同模式的存在,不同大小的DNA片段可以在阵列中分离,因为片段将遵循不同的轨迹。图1总结了分离机制,并给出了纳米级确定性横向位移阵列的轮廓。

在纳米尺度的确定侧向位移阵列中,间隙尺寸仅从微尺度调整到纳米尺度,如果不使用任何其他能改变DNA扩散行为的分子,离子强度(改变有效间隙距离)。在这样的环境下,研究人员发现,第一次,不同碎片长度的流速相关性。主要是在不同的DNA片段的给定大小范围内,改变流速会导致凹凸模式和之字形模式之间的转换:缓慢的速度会导致部分凹凸模式,而高速则会导致所有DNA片段的折叠成之字形。纳米确定性横向位移阵列也可作为DNA片段回收率75%和3倍浓度增强的纯化工具。该工具可以有效地用于准备下一代序列库,芯片内DNA鉴定,以及循环DNA表征应用。

图1。不同流速下的纳米尺度确定性横向位移阵列和DNA分离机制。

下载免费的完整文章*单击下面的链接:

芯片上的凝胶:连续,基于纳米尺度横向位移的速度依赖性DNA分离

本杰明HWunschSung Cheol Kim斯泰西M吉福Yann Astier晁望罗伯特L布鲁斯杰奥蒂卡诉帕特尔伊丽莎白ADuchSimon DawesGustavo Stolovitzky和Joshua T.史密斯,实验室芯片,2018,芯片上的实验室文章

多伊:10.1039/C8LC01053F

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布库古古斯库是荷兰特温特大学中尺度化学系统组的研究员。她的研究兴趣包括开发用于单细胞蛋白质定量分析的微流体装置,下一代测序,芯片研究的分区器官,在微型天平上对水进行脱盐。

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改善天然气提取工艺的微流体

页岩岩

图1。页岩天然气开采。

页岩是一种含粉土的细粒岩石,粘土,矿物颗粒,以及从米到纳米尺度的孔隙。页岩中有机质含量高,用于天然气开采。对页岩储层进行机械刺激,在孔隙中形成渗透性。首选的增产方法是水力压裂。其中,加压流体破裂页岩岩,并使裂缝保持开放状态以进行气体开采(图1)。与现有能源相比,页岩气开采是一个相对较新的过程。由于它是其他消耗性能源的环境友好替代品,它吸引了美国和亚洲越来越多的兴趣,尤其是在21世纪后。另一方面,天然气工业目前正在努力优化利用孔隙空间和分馏物有效提取天然气。在一个新开的页岩储层中,挥发性成分首先从米级蒸发到微米级孔隙,使较重的成分难以进入纳米级的孔隙。剩余组分的提取是储层充分利用的必要条件,但对工业来说是一个难以解决的问题。

最近发表在片上实验室大卫·辛顿和合著者综述了该技术的研究现状,提出了含孔隙页岩的纳米物理模型。作者还通过光学成像和建立气体蒸发的分析模型,研究了纳米孔中气体生成的动力学。他们首先创建了一个与页岩纳米多孔基质特性相匹配的微芯片模型(例如,主要孔隙尺寸和渗透性(图2)。微芯片模型包含大约5800个通过23000个喉道连接的孔,注入碳氢化合物混合物的地方。在模型中,小孔隙的数量(≤10 nm)设计大于大孔隙的数量(~100 nm),以储存大部分可获取的碳氢化合物。这种孔径分布捕获了连接较大孔隙的纳米级喉道的影响,并与页岩生产有关。高,培养基,低过热将其应用于填充微芯片,通过光学成像研究了蒸发的时空动力学。分析模型和实验结果表明,孔隙中的相变(液相到汽相)在很大程度上与相邻孔隙中的相变无关。

这项工作支持这样一种假设,即生产率的快速下降是由于从大的连接特征向纳米多孔基质的转变,随着时间的推移,最小的毛孔中含有较重的部分。作者发现,由于纳米尺度的高温喉道瓶颈,蒸发速度减慢了3000倍。而在低温下,随着轻质组分在大孔中的蒸发,速率进一步降低。即使是直径小于等于10纳米的孔,也能通过严重的选通传输,显著影响较大孔的生产。作者发现这个问题可以通过施加非常低的压力来解决。尽管目前该领域还不可用,水力压裂后期。这一发现似乎为页岩岩石能源加工领域开辟了一条新的道路。

图2。页岩的近景,关于蒸发过程的描述,以及对微芯片操作的描述。

下载免费的完整文章*单击下面的链接:

页岩纳米喉道连通模型中的天然气蒸发:多尺度,多组分多相

阿纳夫·贾图卡兰,俊杰中Ali Abedini阿泰娜·谢巴蒂安,Yinuo Zhao哲慧金Farshid Mostowfi和David Sinton

实验室芯片,2018,芯片上的实验室文章

多伊:10.1039/C8LC01053F

*第条至2019年5月7日免费阅读

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布库古古斯库是荷兰特文特大学中尺度化学系统组的研究员。她的研究兴趣包括开发用于单细胞蛋白质定量分析的微流体装置,下一代测序,芯片研究的分区器官,在微型天平上对水进行脱盐。

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利用微流体筛选脂质库

质膜是生物体的重要组成部分,对所有生命都是必不可少的。它把细胞内部和外部分开,划分反应,并且有选择地允许通过它的传输。虽然许多研究已经涉及到不同的蛋白质和表面分子如何控制质膜的功能,关于脂类成分如何产生特殊性质,人们知之甚少。例如,跨膜蛋白,这也是一大类毒品目标,可能对脂质环境有不同的要求,也可能根据局部脂质成分改变其功能。最近,研究人员来自戴维维兹实验室在哈佛大学,他们开发了一种微流控芯片,用来筛选迄今为止最大的脂质库,为了确定哪些脂质成分对某些蛋白质跨膜结构域具有特异性。这使得研究人员能够研究局部脂质浓度对跨膜蛋白的影响。

质膜通常被称为“简单屏障”。但如果是这样的话,那么,“为什么自然界要经历制造这么多不同类型脂质的麻烦呢?”罗伊·齐布拉特解释说,论文的主要作者。Ziblat认为脂质膜的作用远远大于单纯的屏障,它是加速生物反应的底物。组成膜的脂质的作用是控制哪些生物分子参与这些反应,通过它们对膜蛋白的选择性。现有技术的成功率有限,齐布拉特转向微流体学试图回答这个问题。

微流控芯片包括PDMS中的108个孔阵列,在该阵列中,可以在用另一层PDMS密封芯片之前沉积和干燥脂质膜。脂质体通过在水缓冲液中膨胀而在孔内生成。然后对这些脂质体进行测试,以确定跨膜结构域肽是否会插入其中。然而,因为跨膜结构域的肽是不溶的,他们不能简单地添加到芯片。为了解决这个问题,齐布拉.转向无细胞蛋白质合成。通过将跨膜域肽和purexpress(核糖体的商业混合物)的DNA加载到芯片上,酶,以及用于转录和翻译的核苷酸,肽可以在接近脂质体的位置合成,从而减少降水,增加插入的机会。论文通过齐布拉 .,在7的封面上12月发行芯片实验室,还包括一个有用的视频描述这些方法。Ziblat说,他首先制作了视频,以便更好地与他的主管和同事交流他的方法,但它确实有助于读者理解非常技术的方法论。

往前走,Ziblat希望利用该装置研究其他膜相互作用,如病毒细胞结合。人们还希望这种新的装置和方法能够被用来鉴别作者所称的“可药化脂质”——与特定脂质相互作用的肽,从而更好地将药物导向特定的细胞甚至是细胞器。


要下载全文,请单击下面的链接:

不溶性蛋白跨膜结构域脂质特异性的测定

R.齐布拉特JC.WeaverL.R.ArriagaS.Chong和Da.韦茨

实验室芯片2018,18,三千五百六十一

doi:10.1039/c8lc00311d


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Darius Rackus(右)是Eth z_rich的Dittrich生物分析组的博士后研究员。他的研究兴趣是开发用于医疗保健和生物分析的集成微流体工具。

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用简单的微流控细胞分选装置代替人工组织分离协议

即使是一小群细胞也有能力在组织中植入肿瘤。当涉及到治疗策略的选择时,确定细胞多样性和识别这些小细胞群变得非常重要。从患者身上采集的组织样本需要分离成单细胞悬浮液,因此,可以使用一套强大的技术(包括流式细胞术大量细胞计数法,单细胞RNA测序.然而,将组织分解成单细胞悬浮液并非易事。传统的方法是用刀片将组织样本切成小块,然后在蛋白水解酶的作用下,通过剧烈震动进行机械分解。通过过滤器过滤悬浮液,可以去除大的集料。这项技术显著增加了样品损失,降低了流程的速度,不适合立即进行下游分析。

在这个月的芯片实验室热门文章系列,由加州大学欧文分校的杰瑞德·豪恩博士领导的一组研究人员提出了一种新颖而简单的方法,可以提高使用微流体从组织样本中获得的单细胞悬浮液的质量。杰里米·隆巴多,本文的合著者,解释说:这项工作的目标是用微流体装置完全取代手工强化组织分离方案。“开发的工具是一个由两个尼龙膜组成的微型装置,一个25-50μm筛孔,另一种具有10-15μm筛孔,附在微米大小的孔和微通道上。该装置由激光微加工硬塑料(PET,又名。聚对苯二甲酸乙二醇酯)当与二甲基硅氧烷(一种硅基有机材料)。也,芯片有多层,用于连接不同层次的尼龙网膜(图1)。

细胞分类器

图1。组织样本微流控细胞分选装置。草图显示了内层,由两个膜组成,用于以直接或切向过滤模式操作设备。膜网目大小可根据细胞大小进行调整。右边的显微照片显示了本研究中使用的几种孔径的晶格网络。孔径为(从上到下)50,25,15,直径10微米。

电池分选装置的工作原理

该装置的入口连接到微孔膜以引入组织样本。通过膜的样品通过排出口排出。也可以将一部分样品沿着连接到横流出口的膜表面引导。该装置要么在直接过滤状态下运行,以最大限度地提高样品回收率和处理速度,或者在切向过滤系统中清除较大的组织碎片和细胞聚集物,以防止堵塞。

虽然研究人员最初假设在压力驱动的流动下,当细胞和组织聚集物通过装置的膜时可能会分解,他们惊喜地发现,在这些设备的初始测试中,单细胞数量急剧增加,Jeremy Lombardo说并补充道在开发和测试该装置的过程中,最困难的部分是找到一种膜孔大小的组合,它可以在不影响细胞活力的情况下,最好地分离细胞聚集物和组织。在我们确定最终的50和15μm孔径之前,最终用细胞系和小鼠组织模型对各种孔径和组合进行了彻底的测试。”

优势,挑战与未来

作者总结了该平台的优点芯片实验室博客读者:“这种装置操作极其简单,制造成本也很低。它可以作为一个独立的装置很容易地被纳入许多组织分离应用中,以提高单细胞产量,但也可以很容易地与其他下游微流体操作(细胞分类,检测等)。“据作者说,“在当前的单元分拣机设备格式中,尺寸非常大的细胞可能难以处理,因为它们可能跨越过滤器的多个孔,传统上是过滤掉而不是分离掉的。”虽然看起来像个挑战,通过调整滤膜孔径以适应这些较大的细胞类型,可以很容易地解决这一问题。

对于设备的未来,作者指出,“我们目前还致力于将该设备与上游设备集成,我们之前开发的大型组织分离装置,用于创建完全自动化的微流体组织分离平台。

下载免费的完整文章*单击下面的链接:

带有尼龙网膜的微流体过滤装置能有效地分离细胞聚集物并将组织消化成单细胞。
枭龙秋杰瑞米A隆巴多特丽莎韦斯特霍夫玛丽莎·佩内尔,安妮塔,哈马德·阿尔什泰维,布瑞恩M卢娜,爱德华L纳尔逊,凯克森布鲁克,埃利奥特E回族Jered B.豪恩
实验室芯片,2018,芯片实验室近期热门文章
多伊:10.1039/C8LC00507A

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布库古古斯库是个博士后赫尔实验室在美国加州大学伯克利分校。她的研究兴趣包括开发用于单细胞蛋白质定量分析的微流体装置,下一代测序,芯片研究的分区器官,在微型天平上对水进行脱盐。

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新研究者系列——凯尔·毕肖普

凯尔毕肖普

Kyle Bishop简介:芯片实验室最新的研究者

凯尔毕肖普在Bartosz Grzybowski的指导下,获得西北大学化学工程博士学位,从事自组装纳米级力的研究。博士毕业后,博士。毕晓普是哈佛大学乔治·怀特赛德斯的博士后研究员,在那里他发展了新的策略来控制电场的火焰。他在宾夕法尼亚州立大学化学工程系开始了自己的独立职业生涯。2016,博士。毕晓普搬到哥伦比亚大学,他现在是化学工程副教授。博士。Bishop获得了3M非终身教师奖和NSF职业奖。他的研究试图发现,理解,并运用新的策略组织和引导胶体物质通过自组装和自组织远离平衡。

阅读Bishop博士题为微流控梯度发生器自由对流的测量与抑制'并在下面的采访中了解更多关于他的信息:

你最近发表的研究者系列论文集中在微流体梯度发生器中自由对流的测量和缓解。你的研究是如何从你的第一篇文章发展到最近的这篇文章的?

我们的第一篇文章芯片实验室重点是利用电位梯度在微流体系统中进行能量输送和分离。在这里,我们研究了化学梯度如何驱动流体流动以及胶粒的运动,脂质囊泡还有活细胞。这些主题与我们对利用和指导热力学梯度在小尺度上执行动态函数的持续兴趣有关。

你目前最兴奋的工作是什么?

目前,我们对胶体“机器人”的追求让我们兴奋不已,这些机器人在空间和时间上自发地组织起来执行有用的功能,它可以合理地编码在活性软物质中。

在你看来,微流体梯度发生器的未来是什么?有没有新的申请?

我们对微流体梯度发生器的兴趣源于量化渗透梯度(所谓渗透压)中脂质囊泡的运动的愿望。这些测量受到不期望的梯度驱动流的困扰。我们认为,我们理解和减轻这些流的努力将有助于其他研究梯度驱动的分子。(例如)活细胞的趋化性)。

你觉得你的研究最具挑战性的是什么?

保持专注。世界上充满了许多微小的奥秘,可能会激起你的好奇心,但时间有限。挑选问题并贯彻执行其解决方案是一项前所未有的挑战。

我们的读者会在哪些即将举行的会议或活动中与您会面?

我们小组定期参加年会以及美国化学学会胶体与表面科学研讨会新利手机客户端.

你的业余时间是怎么度过的?

和家人一起探索纽约,思考科学。新利手机客户端

如果你不是科学家,你会选择哪种职业?

多么可怕的想法……也许是一个律师,因为我重视循证推理和法治(物理的或其他的)。

你能和其他早期职业科学家分享一条与职业相关的建议或智慧吗?

大处着眼,经常合作。

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从分离的纳升孔阵列中未加工细胞中定量和多重microRNA分析

麻省理工学院的研究人员开发了一种简单的新芯片,它简化了样品制备,并减少了用于微RNA分析的样品体积。

近年来,微RNA(micrornas)已成为一系列疾病的潜在生物标志物。这些非编码RNA的短(~22个核苷酸)序列通过沉默信使RNA而起作用,因此,提供细胞内转录后调节的形式。因此,它们的调节可以对细胞功能产生重大影响。虽然它们与许多疾病有关,他们在癌症中的作用尤为重要。众所周知,与健康组织相比,肿瘤中的多个小RNA表达失调,可作为肿瘤诊断的生物标志物。对多个小RNA的检测提供了更好的诊断,因此,能够将它们作为一个面板进行测试是很重要的。有很多可以用来检测小RNA的技术,比如基因芯片,定量RT-PCR,和RNA SEQ,但是这些技术都有自己的缺点。他们的共同点是需要制备样品,主要从被测组织或细胞中提取RNA。在他们最近的热门文章中,Tentori和来自麻省理工学院道尔集团 描述一个芯片,它可以克服这个问题,并在最小体积只有几毫微升的范围内对小RNA进行多路测试。

新的芯片包括两个可以夹在一起的玻璃载玻片。底部载玻片有一组直径为300微米的孔,其中包含了微RNA传感器,用于将样品分离到较小的反应体积中。然后使用顶部的载玻片向样品输送溶解试剂。作者尝试了各种各样的顶板设计,但最终在一组直径为30微米的井上沉淀。这有两个优点;1)试剂精确计量;2)上下板夹心牢固,无需精确搬运或对准。最后一点对奥古斯托·滕托里来说非常重要,Doyle集团的一位博士后和论文的主要作者。Tentori希望“制造简单而坚固的设备,因此翻译更容易。”微RNA传感器是聚乙二醇二丙烯酸酯(pegda)水凝胶,含有互补的DNA探针。这些柱在井内和各种尺寸上进行了光聚合。形状,并且可以制作柱子的图案。此外,一口井可以容纳各种岗位,每一个都有一个针对不同小RNA的不同DNA探针进行功能化。这样,利用空间分离可以进行多重分析。芯片的检测方式比以前的检测方式更灵敏,可以从20个以下的细胞中检测到小RNA。

Tentori对这种新芯片的前景感到非常兴奋。他的合作者包括病理学家,他们一直在指导这个项目,以确保它在临床上有用,他真的希望看到这项技术落入病理学家和诊断技术人员的手中。

阅读Tentori等人的完整文章。这里从分离的纳升孔阵列中未加工细胞中定量和多重microRNA分析“其特点是芯片实验室S热门文章集.

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土壤蠕虫如何进行现实的人类生理学研究

老鼠,果蝇,想到斑马鱼很容易想到动物模型对于人类生理学研究来说——但是有一种动物常常被遗忘,尽管它和其他功能一样。你已经猜到了吗?我们说的是土生土长的蠕虫,阿卡 C.雅丽!这些动物将单细胞系统的简单性与动物模型的复杂性结合起来,因此,它们可以为人类疾病提供重要的见解。请花点时间看一下下面的笔记,总结一下C.雅丽.

肌肉力量是人体生理学研究的一个很好的例子,它依赖于钙肌肉收缩肌节组成和组织,以及肌动蛋白和肌球蛋白分子。对这些参数的分析可以揭示肌肉营养不良的形成。肌肉退行性疾病。然而,由于对随机动物行为的依赖,这些参数的测量一直是一个挑战,产生了不可重复的结果。最近,德克萨斯理工大学的研究人员与罗格斯大学和诺丁汉大学合作,研究C.优雅。他们取得了结果与动物行为和步态无关在一个由弹性微孔林组成的微型系统中(图1a和1b)。

微流体系统由二甲基硅氧烷,并包含可弯曲的微柱悬挂在微通道天花板上。支柱在身体肌肉的作用下弯曲,当C.雅丽爬过柱子阵列。单个支柱弯曲事件可以使用显微镜摄像系统和图像分析进行量化(图1c)。支柱密度设计用于高机械阻力运动,因此,可以独立于动物行为来测量最大可施加力。在这里,最大可行力对应于标准化的人股四头肌施加的峰值力。膝关节伸展阻力试验.

图1。(a)带支柱森林和端口的微流体装置的图像。(b)C的示意图演示。线虫测力仪。插图显示了这些柱子的扫描电子显微镜照片。(c)虫体与柱子相互作用的示意图。由于身体肌肉的作用,支柱弯曲(以红色和绿色显示)。拉赫曼的照片.

这项研究的作者解释说,动物在高阻力区域产生强大的力量,并根据相对于柱子间隙的身体尺寸展示不同的运动方式。除了体型大小,身体结构和行为特征可能是力的大小施加在柱子上。由于所施加力的参数来源的概率性质,一个可重复的算法可以定义量化肌肉力量。使用这个策略,研究人员发现第一次微流控柱之间的运动包括三种状态:非电阻(蠕虫与1-2柱接触,不调整身体姿势)。中等阻力(蠕虫接触2根以上的柱子,最小限度地调整身体姿势)和高阻力(蠕虫接触多个支柱和身体姿势调整被禁用)。操作时高阻区,微流体系统抑制动物行为。该系统允许(1)区分不同年龄个体蠕虫的肌肉强度或虚弱程度,(2)测定左旋咪唑治疗后的体长下降和肌肉收缩水平。(3)野生和突变体的肌力比较C.雅丽类型。据研究人员称,未来的研究有助于我们深入了解神经肌肉功能的分子和细胞回路,以及对废弃的退化过程的解剖。老化,和疾病。

下载免费的完整文章*单击下面的链接:

NEMAFLEX:一种基于微流体技术的标准化C肌肉强度测量。雅丽
Mizanur Rahman珍妮佛E休伊特弗兰克·范·布塞尔,Hunter Edwards杰兹·布拉兹·齐威茨,纳撒尼尔J。Szewczyk莫妮卡·德里斯科尔德,Siva A.瓦纳帕利
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我们对癌症的了解

癌症比我们想象的要复杂得多:除了癌细胞,支持组织细胞,脂肪,甚至在肿瘤中也能发现免疫细胞。这些细胞群之间的组合串扰影响肿瘤的发展方式或对药物治疗的反应。另一方面,我们对肿瘤的了解主要是通过研究细胞群获得的。最近在提高我们对癌症的理解方面取得的进展表明,由于整体平均测量,我们长期以来一直缺少随机的相互作用和罕见的事件。我们可以揭示这些细胞群是如何协同工作的,以及这些罕见的事件是如何改变肿瘤的命运的。单细胞分析技术。

单细胞可以通过外源性和内源性标记来识别。外源性标记对细胞的遗传和蛋白质组学状态具有决定性。流式细胞术质谱法一直是外在标记分析的主力军,遗传或蛋白质组学材料通常被荧光标记用于检测。有了这些技术,多重分析成千上万的细胞可以同时使用。内在标记包括大小,形状,密度,光学的,机械的,以及不需要贴标签的电气性能。微流体技术提供了大量不同的功能,以根据内在标记对细胞进行分类。外部和内在数据的结合促进了我们对肿瘤发展和药物反应中细胞间差异如何反映细胞异质性的理解。虽然有许多强有力的方法可以用来确定外源性标记物,很少有技术能够收集到关于不同内在标记面板的信息。

最近的研究生物微技术与生物群系在麻省理工学院代表了一个重要的微流体方法的发展多参数内在细胞测量工具。该方法包括几种不同的微流控模块,结合显微镜成像和机器学习的图像处理。测量电池尺寸的单独模块,变形性,极化可以在工具内组合和组织(图1)。(i)尺寸模块通过光学方式检测流经系统的电池尺寸。细胞大小模块是分离不同细胞类型所必需的,这些细胞类型可以提供有关疾病状态的重要线索。(ii)在变形性模块中,细胞通过狭窄的通道,它们的通过时间决定了变形能力。细胞变形性提示了与癌症进展相关的细胞骨架和核变化。(iii)极化模块中,固定频率的介电发声力被施加在由相反的水动力驱动的电池上。根据极化率的不同,电池接近具有不同平衡位置的共面电极。细胞极化率可以区分生物学表型的细微变化。作为概念工作的证明,首次使用五种不同的内在标记物检测到药物诱导的细胞结构变化。包括大小,变形性,三个频率的极化率。作者指出,这种强大的工具可以进一步配备视觉读出功能,如确定性横向位移阵列,惯性微流体,声音传递,光学技术。

图1。多参数本征细胞术将不同的微流控模块与细胞追踪结合在一个底物上,以将每个细胞的信息关联到不同的本征属性,包括大小,极化率,以及变形性。

下载免费的完整文章*单击下面的链接:

单细胞特性的多参数细胞跟踪固有细胞术
Apichitsopaa.贾菲J.沃尔德曼
实验室芯片,2018,芯片实验室最近的热门文章
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*文章免费阅读至2018年8月31日

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分子诊断中用于质量的逐卷PDMS芯片

用于分子诊断的PDMS微流控装置现在使用卷到卷的制造方法大规模生产。

如果有一种材料能够在学术界进行微流体研究,聚二甲基硅氧烷(PDMS)是必然的。PDMS是一种廉价且易于原型化的产品,它的弹性特性导致了复杂的结构(例如微流体通道中。虽然它对于快速原型设计非常有用,由于缺乏可扩展的生产方法,原型制造和高通量制造之间往往存在着脱节。芬兰VTT技术研究中心和加州大学伯克利分校的研究人员最近报告了一种逐卷制备PDMS微流控芯片的方法。

在纸业常见的卷对卷(R2R)加工中,长板材被连续加工,通过具有不同功能的辊和模块送料。形成R2R微流控器件,将聚二甲基硅氧烷(PDMS)应用于镀铝纸基片上,再经加热镍压印筒压印,使其固化。该器件具有良好的再现性,通道深度达到100微米左右。从nikel master复制是自动化的,以1.5 m/min的高吞吐量执行。奥利·海基·赫图宁,论文的作者之一,说“虽然这个过程需要很多微调,它非常简单。”就像其他高吞吐量制造技术(例如注射成型)镍工具很贵,但这些成本可以通过产量来克服。

作为原则适用的证明,作者证明了环介导的等温扩增(LAMP)检测核酸的方法。试剂在微通道中被发现并用一个卷对卷兼容的点胶机干燥,通过卷对卷工艺(尽管通孔是手工冲压的)形成了用于流体和真空连接的带有通孔的PDMS盖,然后手动粘合。Huttunen说,下一步要解决的是如何制造整个设备的滚动,但这不应该太具有挑战性。

用镀铝纸作为器件的基片,有两个优点。一种是铝显著降低了纸张的自发荧光。另一个优点是铝反射了激发光和发射光,产生更强的信号。测试结果可以在20分钟内读取,这表明这些设备对于低成本的护理点测试是有用的。

未来的挑战,通讯作者Luke Lee说,这将是“学习滚动微流体的新思维和设计规则,以解决所有人在集成分子诊断中的大规模生产问题。”这对于PDMS和微流体界来说是一个令人兴奋的新前景。

免费阅读全文*,单击下面的链接:

用于分子诊断的PDMS微流控装置现在使用卷到卷的制造方法大规模生产。

*文章自2018年6月6日至2018年7月6日免费阅读

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磁带设备中细胞生物学的“前沿”技术

像标签一样的设备可以快速,细胞培养实验的快速原型制作

X射线摄影术,或者剃刀印刷,是一种制造微流体装置的低成本、易接近的方法。使用电脑控制的剃刀刀,材料薄片可以精确地切割成一种设计。使用粘合材料,切割图案可以像贴纸一样使用,然后,通过将贴纸堆叠和分层来制作微流体装置,从而形成三维结构。虽然剃刀切割设备的分辨率可能与软光刻不同(150μm与10-30μm)其易于制造和快速周转时间使该方法非常用户友好,是快速成型的好方法。Jay Warrick(美国威斯康星州)和玛丽贝拉·多梅内奇(美国波多黎各Mayag_ez)希望与剃刀切割的微流体技术合作。

获得一个非常容易的制造方法成为多梅内克的必要条件。在2016年一场电气火灾摧毁了她的实验室和软光刻设备之后,多梅内克正在寻找一个简单的方法继续她的研究,同时等待装修完成。因为她主要是研究生,她需要一种具有温和学习曲线的捏造方法。“光刻方法太难掌握在几周内,但是剃刀切割的设备很容易被任何人制造和使用,”多梅内奇说。

尽可能简单易用,除非得到信任,否则它不会被社区广泛采用。对于生物学家来说,这意味着相信这种材料是生物相容的,不会干扰他们的实验。在他们最近的报告中,多梅内奇和沃里克应对这一挑战,并通过彻底描述Arcare 90106为社区服务,用于xurography的双面胶带。将胶带与聚苯乙烯和PDMS装置进行比较,细胞生物学和微流体的面包和黄油材料,分别。该磁带在多种细胞生长指标和多种细胞类型上表现出良好的性能。此外,在亲脂性分子的吸收方面,与PDMS相比是有利的,这意味着它不太可能干扰细胞外分子(例如,激素,细胞因子,生长因子等)非常重要。

基于磁带的简单生物相容性设备为细胞生物学开辟了新的机遇。沃里克说:“它能很好地将这些设备附着在许多不同类型的表面上。”因为磁带很灵活,它既可以贴在曲面上,也可以贴在平面上。它还为将新材料与微流体设备集成提供了机会。沃里克说,他“经常看到不同的材料,并希望有一个简单的方法来整合它们。胶带解决了这个问题,“就新材料而言,研究小组演示了电纺胶原蛋白片在剃刀切割的微流体装置中的整合。合著者Yasm_n_lvarez Garc_a目前正在调查其他哪些材料可以合并。她希望扩大目前的工作,包括更多的细胞类型,进行细胞迁移研究,并扩展该技术的可用性。这将进一步提高磁带生物相容性的可信度,并降低更多生物学家进入微流体的障碍。

免费阅读全文*,单击下面的链接:

用于基于细胞的应用的剃刀印刷贴纸微型设备

doi:10.1039/c7lc00724h(纸)芯片实验室二千零一十八,18,四百五十一

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关于网络作家

Darius Rackus(右)是多伦多大学的博士后研究员,在惠勒实验室.他的研究兴趣是将传感器与数字微流体相结合,用于医疗保健应用。

*2018年2月28日前免费使用

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