不要依靠直觉:研究微生物群/人类共代谢

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流行科学(和商业)的一个新趋势是个人DNA检测。新利手机客户端很多公司都认为你的基因遗产会让你与众不同,揭示你的真实身份。你真的想知道你在分子水平上是什么吗?如果是数字游戏,你大部分是细菌(这就是为什么你这么有教养!).细菌数量超过我们身体的细胞1.3:1。大多数细菌存在于胃肠道,为太古宙的微生物群作出贡献,与人体有共生关系的真核生物和病毒。

微生物群与许多重要的生理途径有关,包括人类营养(获取更多的能量和营养)。免疫,异种物质的炎症和解毒作用。相反地,这种途径的失调与糖尿病等疾病有关。癌,炎症性肠综合征和心血管疾病。由于涉及的路径数量,希望通过对微生物群的研究,可以为疾病的治疗或生物标志物确定酶靶点。

然而,对这些途径的了解有限,研究进展依赖于分析工具的进步。由瑞典乌普萨拉大学的丹尼尔·格洛比什博士领导,研究人员开发了一种分析方法来鉴别o-硫酸盐代谢物。微生物能够进行一系列代谢反应,补充人体酶的功能,和o-硫酸盐功能化是微生物/人类共代谢的特征,因为它可以被细菌硫转移酶催化。

使用硫酸酯酶-硫酸酯酶处理和UPLC-MS/MS可以选择性地分析O-硫酸酯酶功能化分子。

o-硫酸盐功能化分子可以使用硫酸酯酶处理和UPLC-MS/MS选择性分析。

研究人员开发了一种检测方法来鉴定o-尿液和粪便样本中的硫酸盐化合物。该分析是用一种能够水解多种芳基硫酸盐分子中氧-硫键的硫酸盐酶设计的。用这种酶处理样品,并用UPLC-MS/MS(超高效液相色谱/串联质谱)分析所得混合物。结果与未经酶处理的对照样品的数据输出进行了比较,并与79.9568质量变化的光谱特征进行了比较。M/Z(硫酸盐组的损失)被确认,导致识别206o-硫酸盐代谢物。这是一个值得注意的结果,因为它使人类代谢数据库中目前记录的硫酸盐代谢物数量增加了三倍。

许多有趣的化合物被鉴定出来:阿魏酸是一种由微生物群产生的代谢产物,被认为可以防止血栓形成和关节硬化,以及吲哚硫酸盐和-甲酚硫酸盐是慢性肾病和心血管疾病的生物标志物,分别。上面提到的是206个未被发现的分子,简要介绍了进一步研究的应用,有了正确的分析工具,可能会发现。

要了解更多信息,请阅读:

用于肠道微生物群衍生代谢物选择性研究的酶和质谱新方法

卡罗琳芭蕾舞团,马里奥SP.Correia路易斯·P·P考平特丽萨L洛歇劳拉C莱曼Neeraj Garg米罗斯拉夫·武贾西诺维,塞巴斯蒂安·迪恩德尔,J.-Matthias L_hr,丹尼尔·格洛比什。
化学。SCI。,2018,先进文章
多伊:10.1039/C8SC01502C

关于作者

Zo_Hearne是蒙特利尔麦吉尔大学化学博士生,新利手机客户端加拿大在李超教授的监督下。她来自堪培拉,澳大利亚在那里她完成了她的本科学位。她目前的研究重点是过渡金属催化,以实现新的转变,在实验室之外,她是一位热情的化学导师和科学传播者。新利手机客户端新利手机客户端

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