电子实验室记事本(ELN)和Chemspider的功能在一定程度上重叠——都存储化学信息,包括结构,数据,光谱和反应。然而,大多数榆树的重点是管理,跟踪和审计数据,而Chemspider将向世界发布和传播它。我们一直在考虑如何最好地使用这个补充功能将ELN与Chemspider集成在一起。
在今年8月举行的“智能实验室:走向国家ELN”会议(作为Dial-A-分子EPSRC大挑战的一部分组织)上,播种是为了做到这一点。剑桥大学在英国拥有第一个化学系,在整个系范围内推出电子实验室笔记本系统新利手机客户端。他们使用的软件是IDBS的电子工作簿套件.与IDBS和剑桥化学系合作,新利手机客户端我们在Chemspider制作了一个插件,可以动态地将Chemspider中的信息检索到它们的ELN中,以另一种方式发布。剑桥化学新利手机客户端系(蒂姆·狄更斯博士,布赖恩·布鲁克斯博士,Bobby Glenn教授和Steven Ley教授)在允许使用ELN编写插件方面非常有帮助,并将成为第一批用户,但结果将免费提供给任何现有的IDBS电子工作簿套件用户。
关于这个扩展,博比·格伦教授说:“很多化学物质都失去了,新利手机客户端它根本就不发表,在被遗忘的实验室笔记本里也不受欢迎。在像Chemspider这样的可搜索数据库上合成后很快捕获新的分子,现在是一个直接从ELN轻松完成的过程,这将极大地促进化合物的共享,合成方法和所有相关数据。这是给化学家的即时信息。Chemspider战略发展副总裁安东尼·威廉姆斯(Antony Williams)补充道:“现在能够将IDBS ELN的复合数据直接发布到Chemspider,这为直接接触新化学以及从事这项工作的化学家提供了一条途径。”新利手机客户端这种公共化合物登记能力是向社区最终公开合成方法和相关实验数据的第一步。通过这次合作,我们的愿景即将实现。”
要查看插件操作,请查看Chemspider e-Workbook套件插件演示影片.
如果化合物在实验中被完全提取出来(无论是作为单个结构还是作为反应的一部分),则可将其公布给Chemspider。不管它们是否简单地作为反应文件上传到实验中,或包含在例如电子表格项中。同样地,如果你想了解更多关于在实验中完全提取的化合物的信息,化合物结构可以自动加载到Chemspider的搜索中。或者,如果您已经向Chemspider发布了一个化合物并希望看到生成的化合物页面。Chemspider中生成的复合页面将具有数据源“IDBS电子工作簿套件”。外部ID将显示结构所在的实验的ID,以及ELN的Chemspider设置中定义的储户详细信息。
Chemspider IDBS E-Workbook Suite插件可免费向IDBS E-Workbook Suite的客户下载国际存托凭证,请并将其复制到IDBS电子工作簿套件程序文件中的适当位置。它与9.0和9.1版的电子工作簿套件兼容。
这个插件是概念的初步证明,它证明我们可以在Chemspider和ELN之间双向传递复合信息。未来的版本将允许将实验中的更多信息发布到Chemspider,例如允许将反应及其方法的描述发布到Chemspider合成页面,或者将光谱和化合物一起沉积到Chemspider。我们还想把其他榆树和化学平皿结合起来。