ChemSpider插件为IDBS ELN - RSC发布创新

ChemSpider插件IDBS ELN

2011年12月08

通过亚都。

电子实验室笔记(ELNs)和化学蜘蛛的功能在一定程度上重叠——两者都存储化学信息，包括结构、数据、光谱和反应。然而，大多数eln的重点是管理、跟踪和审计这些数据，而ChemSpider的重点是发布和传播这些数据。我们一直在考虑如何最好地使用这种互补的功能来集成ELN和ChemSpider。

在今年8月举行的“智能实验室:迈向国家ELN”会议(该会议是Dial-a-Molecule EPSRC Grand Challenge的一部分)上，人们播下了实现这一目标的种子。剑桥大学有英国第一个化学系推出全系范围的电子实验笔记系统，他们使用的软新利手机客户端件是idb的E-WorkBook套件。在与IDBS和剑桥大学化学系的合作中，我们ChemSpider开发了一个插件，它既可以新利手机客户端动态地从ChemSpider检索信息到它们的ELN，又可以以另一种方式发布信息。剑桥大学新利手机客户端化学系(蒂姆·狄更斯布莱恩•布鲁克斯博士教授鲍比格伦和史蒂文·雷教授)在授予访问他们的民族解放军很有帮助编写插件,并将它的第一个用户,但结果将是免费的任何现有的idb E-WorkBook套件用户。

关于这种延伸，博比•格伦教授曾说:“化学的很多东西都消失了，它们根本没有发表，在被遗忘的实验室笔记中消失了。”新利手机客户端在像Chemspider这样的可搜索数据库中捕获合成后不久的新分子，现在是一个直接从ELN获得的轻松过程，这将极大地鼓励共享化合物、合成方法和所有相关数据。它是化学家的即时通讯工具。”Antony Williams (ChemSpider的战略发展副总裁)补充道:“现在可以直接向ChemSpider发布IDBS ELN的化合物数据，这为直接接触新化学和化学家工作提供了一条途径。”新利手机客户端这种公共化合物注册功能是最终向社区公开合成方法和相关实验数据的第一步。通过这次合作，我们的愿景即将实现。”

要查看正在运行的插件，请查看ChemSpider电子工作簿套件插件演示影片。

启动发布到ChemSpider插件的屏幕截图

化合物可以发布到ChemSpider如果他们已经吸引了全部在一个实验——这是作为一个个体是否结构或反应的一部分,以及他们是否只是上传实验作为反应文件,或包含在一个电子表格项目。同样地，如果您想要查找关于已经在实验中完全画出的化合物的更多信息，或者您已经向ChemSpider发布了化合物并希望看到得到的化合物页面，那么复合结构可以自动加载到ChemSpider的搜索中。ChemSpider中生成的复合页面将具有数据源“IDBS电子工作簿套件”。外部ID将显示结构来自的实验ID，以及ELN的ChemSpider设置中定义的存款人详细信息。

ChemSpider IDBS电子工作簿套件插件可从其中下载，免费提供给IDBS电子工作簿套件的客户idb，并将其复制到IDBS电子工作簿套件程序文件的适当位置。它与电子工作簿套件版本9.0和9.1兼容。

这个插件是一个初始的概念验证，它演示了我们可以在ChemSpider和ELN之间双向传递复合信息。未来的版本将允许实验中的更多信息发布到ChemSpider—例如，允许化学反应及其方法的描述发布到ChemSpider SyntheticPages，或将光谱连同化合物一起沉积到ChemSpider。我们还希望将其他eln与ChemSpider集成。